Además de la caza, las focas arpa se enfrentan a otras amenazas. Tal y como señala la International Fund for Animal Welfare (IFAW), otros riesgos son "las propuestas de realizar una matanza selectiva e intensa de poblaciones de focas para beneficiar a la pesca; la disminución de su alimento debido a la pesca excesiva o el cambio climático; la captura incidental en equipo de pesca, así como los contaminantes ambientales".